確かに小口出品は
1点注文ごとに100円の基本成約料＋注文成約時にかかる販売手数料
それに加えて、アカウントの設定完了時に、アカウント確認料として1円が請求されます。
https://services.amazon.co.jp/services/sell-on-amazon/individual-promerchant.html?ref=as_jp_jp_nav_soa_proindi

4,900円＋税金を請求されているのなら、それは大口出品で登録をしたということです。
登録した際にどの画面から登録したのか今一度下記過去トピックをご覧になってみてください。
どの画面も料金の記載があったはずです。
https://sellercentral.amazon.co.jp/forums/t/topic/12990/

ちなみに登録してからセラーセントラルの設定にある
出品用アカウント情報を見れば自分が小口出品者か大口出品者かの確認もできたはずです。
（セラーセントラルの右上にある「設定」→出品用アカウント情報→ご利用のサービス→Amazon出品サービス）

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