オートを停止すれば 問題ないと思いますが
私は 以前は オートターゲティングでしたが 検索キーワードレポートを見ると
検索語が ASINが 多いので マニュアルのみで 運用しています。
マニュアルだと 検索された語句が分かるので
ですので 削除は出来ない仕様らしいので
オートの期限を設定し 動かないようにすればいいと思いますよ

両方で 運用はした事が無いので ↑の件は分かりませんが
両方で運用してる方の レスがあるといいですが 無い場合は TSへ聞いて下さい。

年に数回 広告キャンペーンのweb講座があります
(コロナ禍で少ないですね そういえば最近無いです)ので 参加し
最後に質疑応答もありますので 色々聞けて 勉強になります。