元々無い？シュリンク商品でしょうか？
箱入りだが本体のみの意でJANコードもプリントされないのでしょうか？

自社出荷だと仮定します
FBAなら必要ですが・・・・新品しか販売できない商品ではないでしょうか？

箱入りで箱無しは・・・ほぼ新品（amaでは中古商品）
ヘルプ見ておりませんが、フリマサイトとは違うので難しいかと思いますが

FBAになりますが
FBA商品(新品)の販売要件Amazon

Amazon> ビューティーカテゴリーでは、新品の商品のみ出品が許可されています。

• 新品： 未使用かつ未開封で、元の包装のままで同梱品がすべてそろっている商品。賞味期限、消費期限のある商品については、購入するお客様が消費するのに十分な日付を残した商品を出品すること。なお、賞味期限、消費期限が切れた商品は出品することができません。
  出品不可のビューティー商品： 出品不可の商品は以下をご参照ください。

出品制限商品

制限対象商品 / 医薬部外品および化粧品