混合在庫として、商品のSKUが、登録されているものと思います。
そのまま、納品して大丈夫です。
どうしても、amazonラベルを、貼って納品したいと、お考えであれば、

セラーセントラル の「設定」から「FBA設定」を選択し、「FBA商品のバーコードの設定」を「Amazonの商品ラベル」に変更いただいた後、
現在混合在庫で登録されているSKUを在庫管理から一度削除し、再度別SKUで登録する必要があります。
別SKUで登録が完了しましたら、FBA出荷への切り替え時に、バーコードタイプを選択する項目が表示されるので、
その際に「Amazonの商品ラベル」を選択すると、amazonのラベルが、印刷可能となります。