マーケットプレイス配送（ヤマト急便）にて出荷した荷物のうち2件、出荷伝票とセラーセントラルの注文画面に表示される伝票番号（追跡番号）が相違しており、「出荷通知がされていないためキャンセル」処理が行われました。

今までこのようなことがなかったため、伝票を出力した際に伝票に記載されている番号と画面に表示されている番号を確認しなかったこと、そして集荷後にしっかりと発送済になることを確認しなかったことは当方に責任がありますが、なぜこのようなことになったのかが理解できません。
伝票を印刷する際、表示された印刷画面から直接印刷すると伝票に上手く印刷ができないため、伝票を印刷する際は全てスクリーンショットを取った上で伝票を印刷しております。そのため、全て伝票の控えは残っており、そちらの伝票と集荷時にいただく控えの番号は２件共に一致しております。
そしてその２件は追跡によりお客様へ配達済と確認できています。（当方の売上データなどから確認が取れます。）

考えられる原因として、配送伝票を返金したとして、返金された伝票で出荷してしまったか。ということですが、私の処理手順上このようなミスが起こることが考えられません。
（返金した伝票を印刷することが考えられないため）
ヤマトも伝票番号はスキャンで読み込むため、番号を間違えたということも考えにくいです。

このようなご経験をされた方がいらっしゃいましたらご教示くださいませ。

高額な売上金を失いパフォーマンスに影響するとなると今までミスなく育ててきたのにとても残念でなりません。

よろしくお願い申し上げます。