お察しいたします、同業者の継続攻撃（自社販売の邪魔するな的な）でないといいのですが

＞何故かどのような手を使ったか不明ですが？48時間経たない内に承認され返金処理も終了しました

承認理由詳細がわかりませんが、承認対象事項(返品拒否・その他印取配達/出着遅延・他アマゾン拒否理由）に該当しますと即承認はよく耳にします、某国上流的扱いも都市伝説であるようです

＞そのマーケットプレイスが不良率に加算され結果、60日間で１％を超え「おすすめ出品」の表示がされなくなりました

カートやマケプレお急ぎ便などと同じで表示外され、いつ戻るのか？正解な回答は難しく、開示あっても戻るか戻らないかは様々な辱件があるようです、早く戻る方もいれなかなか戻らない方もいるということです

＞ヘルプから48時間経っていない事や商品に問題がなかった事も連絡しても定型文の返信が来るだけで対応していただけません

規則なので、その表示対応以外は出来ないということです

＞このような場合、おすすめ出品表示に戻るまでどれくらいの時間がかかるのでしょうか？60日なのでしょうか？

１日目１０日目３０日目６０日目とか毎日％が変わり（トピ主様の対象販売量不明なので）途中で正常に戻るといいのですが戻ったからといって即日、おすすめ表示がアップ、されるとは限りません、↑コメント同様早く戻るか？なかなか戻らないか？サポート側でもわかりません

＞またこのような嫌がらせには何か対応する方法はないのでしょうか？

嫌がらせだと証明して相手に連絡するしかございません

BLのないamazonでは購入者を選べません、セラー側の判断でペナルティー覚悟で出荷しないか程度です

経験者様からもっと良い対策教えてもらえるといいですね